El IIAD fue creado en mayo de 1999 como estrategia de apoyo a la I+D+I en el área de la Ciencia e Ingeniería de Alimentos en la Universidad Politécnica de Valencia.

Desde sus inicios el Instituto pretende incidir con sus actividades en aquellos factores del desarrollo relacionados con los alimentos que faciliten objetivos tales como: un aprovechamiento más racional de los recursos naturales, una mayor calidad y seguridad en los alimentos, unos procesos de fabricación y conservación más higiénicos, eficientes y respetuosos con el medio ambiente.

Las distintas líneas de investigación abordadas en el IIAD han permitido el desarrollo de tecnologías adecuadas para que la Industria Alimentaria contribuya a la salud, al bienestar de la población y a la generación de riqueza y de trabajo, todo ello mediante el progreso de los conocimientos y la mejor aplicación de las técnicas propias de la Ingeniería de Alimentos.

El IIAD realiza también una intensa actividad formativa dirigida a la capacitación de personal, y en general en acciones dirigidas a favorecer el intercambio de conocimientos e incluso de negocios entre Universidades, Centros de Investigación y Empresas. Esa actividad se está realizando tanto en el entorno europeo como en el latinoamericano.